- Вивчення закономірностей епідемічного процесу та розробка наукових основ профілактики інфекційних хвороб; - Розробка та вдосконалення системи епідеміологічного нагляду за інфекційними хворобами; - Розробка нових та вдосконалення існуючих методів діагностики, лікування та профілактики інфекційних хвороб; - Вивчення імунологічних, патогенетичних та клінічних особливостей перебігу інфекційних хвороб; - Біологічні властивості збудників інфекцій та їх роль в патогенезі інфекційних хвороб - Наукове обґрунтування стратегії використання протимікробних засобів та оцінка їх ефективності; - Виконання фундаментальних та прикладних наукових досліджень з актуальних проблем інфекційної патології людини - епідеміології, мікробіології, вірусології, паразитології; - Проведення генно-молекулярних досліджень; - Вивчення та узагальнення досягнень світової науки; - Виявлення принципово нових можливостей наукового та науково- технічного прогресу; - Захист приоритету винаходів; - Підготовка рекомендацій щодо використання результатів наукових досліджень в практиці охорони здоров`я; - Розробка проектів та пропозицій про основні напрямки розвитку наукових досліджень в галузі та пропозицій щодо реформування інфекційної служби; - Розробка та обгрунтування програм контролю та зниження рівня захворюваності, ліквідації інфекцій. - Контроль за якістю імунобіологічних препаратів, що виготовляються в Україні та за кордоном.
Клінічні:
- надання висококваліфікованої допомоги інфекційним хворим; - удосконалення існуючих та застосування нових методів лікування та діагностики інфекцийних хворих з метою прискорення їх одуження та попередження хронізації процесу; - надання поліклінічної та реабілітаційної допомоги інфекційним хворим; - надання консультативної допомоги іншим закладам охорони здоров`я.
Експертні:
- експертиза НДР, що плануються та завершуються іншими науковими установами з профілю роботи інституту; - експертиза кандидатських та докторських робіт; - експертиза нових наукових проектів; - експертиза нових імунобіологічних та дезінфекційних препаратів; - експертиза наукових робіт, що плануються до друку.